El colegio se ubica en el antiguo convento franciscano, construido en 1604, fue enajenado por el Estado en 1835, tras la exclaustración y desamortización de Mendizábal. Después de diversos cambios de propiedad, la Marquesa de Campoameno lo otorgó en testamento a los Padres Salesianos, aceptándose la herencia en 1913, pero éstos no abrieron escuelas salesianas hasta el año 1916. Años más tarde, el inolvidable padre salesiano D. Juan Bigatti, acometió la obra de reconstrucción del colegio y de la iglesia.
Continuó esta presencia salesiana hasta el año 1967, y ya en 1984, el entonces alcalde D. Jesús Ruiz Fernández, lo adquirió para el Ayuntamiento y lo cedió al Ministerio de Educación que lo insertó como colegio público manteniendo el nombre de Campoameno.